MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 97244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009484	GGC	2	6	229278	229283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259218
6002	NC_009484	CGGG	2	8	229322	229329	0 %	0 %	75 %	25 %	148259218
6003	NC_009484	GCT	2	6	229349	229354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259218
6004	NC_009484	GATCGC	2	12	229358	229369	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148259218
6005	NC_009484	CG	3	6	229397	229402	0 %	0 %	50 %	50 %	148259218
6006	NC_009484	CGG	2	6	229449	229454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259218
6007	NC_009484	GC	3	6	229466	229471	0 %	0 %	50 %	50 %	148259218
6008	NC_009484	CTG	2	6	229482	229487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259218
6009	NC_009484	CG	3	6	229550	229555	0 %	0 %	50 %	50 %	148259218
6010	NC_009484	GCCG	2	8	229584	229591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6011	NC_009484	GAC	2	6	229623	229628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_009484	GCC	2	6	229648	229653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_009484	GTG	3	9	229662	229670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_009484	CATG	2	8	229697	229704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6015	NC_009484	GCCG	2	8	229723	229730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6016	NC_009484	GCC	2	6	229824	229829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6017	NC_009484	A	6	6	229882	229887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_009484	CAT	2	6	229953	229958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_009484	GGC	2	6	230044	230049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_009484	GGC	2	6	230087	230092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259219
6021	NC_009484	GAG	2	6	230134	230139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259219
6022	NC_009484	CGC	2	6	230165	230170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259219
6023	NC_009484	GCC	3	9	230303	230311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259219
6024	NC_009484	GCC	2	6	230376	230381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259219
6025	NC_009484	GAT	2	6	230519	230524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259219
6026	NC_009484	CGG	2	6	230546	230551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259219
6027	NC_009484	CGA	2	6	230555	230560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259219
6028	NC_009484	CTT	2	6	230607	230612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259219
6029	NC_009484	GCG	2	6	230667	230672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259219
6030	NC_009484	CGC	2	6	230681	230686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259219
6031	NC_009484	TC	3	6	230688	230693	0 %	50 %	0 %	50 %	148259219
6032	NC_009484	CG	3	6	230718	230723	0 %	0 %	50 %	50 %	148259219
6033	NC_009484	CGA	2	6	230735	230740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259219
6034	NC_009484	GC	3	6	230745	230750	0 %	0 %	50 %	50 %	148259219
6035	NC_009484	CAC	2	6	230822	230827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259219
6036	NC_009484	GTT	2	6	230837	230842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148259219
6037	NC_009484	GAA	2	6	230909	230914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259219
6038	NC_009484	TTG	2	6	230931	230936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_009484	GGCG	2	8	230963	230970	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6040	NC_009484	CGAG	2	8	230974	230981	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6041	NC_009484	GTC	2	6	231228	231233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259220
6042	NC_009484	TGA	2	6	231284	231289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259220
6043	NC_009484	CGA	2	6	231308	231313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259220
6044	NC_009484	CG	3	6	231338	231343	0 %	0 %	50 %	50 %	148259220
6045	NC_009484	TGG	2	6	231368	231373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259220
6046	NC_009484	GCC	2	6	231466	231471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259220
6047	NC_009484	GCGG	2	8	231473	231480	0 %	0 %	75 %	25 %	148259220
6048	NC_009484	CCG	2	6	231491	231496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259220
6049	NC_009484	GCA	2	6	231684	231689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_009484	ACGGG	2	10	231703	231712	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6051	NC_009484	GGC	2	6	231728	231733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_009484	CCG	2	6	231774	231779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6053	NC_009484	CGGC	2	8	231792	231799	0 %	0 %	50 %	50 %	148259221
6054	NC_009484	CACC	2	8	231900	231907	25 %	0 %	0 %	75 %	148259221
6055	NC_009484	CCGG	2	8	231953	231960	0 %	0 %	50 %	50 %	148259221
6056	NC_009484	GCG	2	6	231986	231991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259221
6057	NC_009484	GTG	2	6	232001	232006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259221
6058	NC_009484	CGA	2	6	232113	232118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259221
6059	NC_009484	GCCG	2	8	232149	232156	0 %	0 %	50 %	50 %	148259221
6060	NC_009484	CGG	2	6	232182	232187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259221
6061	NC_009484	CAG	2	6	232189	232194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259221
6062	NC_009484	GC	3	6	232248	232253	0 %	0 %	50 %	50 %	148259221
6063	NC_009484	GAT	2	6	232306	232311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259221
6064	NC_009484	GC	3	6	232367	232372	0 %	0 %	50 %	50 %	148259221
6065	NC_009484	GGC	2	6	232380	232385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259221
6066	NC_009484	GCGT	2	8	232439	232446	0 %	25 %	50 %	25 %	148259221
6067	NC_009484	CGG	2	6	232447	232452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259221
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6069	NC_009484	CGG	2	6	232537	232542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259221
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6071	NC_009484	TGA	2	6	232584	232589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259221
6072	NC_009484	GAT	2	6	232624	232629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259221
6073	NC_009484	TGC	2	6	232647	232652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259221
6074	NC_009484	CGC	2	6	232683	232688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259221
6075	NC_009484	CGA	2	6	232827	232832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259221
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6079	NC_009484	GCC	2	6	232882	232887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259221
6080	NC_009484	GCC	2	6	232891	232896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259221
6081	NC_009484	GCC	2	6	232918	232923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259221
6082	NC_009484	GCC	2	6	232927	232932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259221
6083	NC_009484	GCC	2	6	232954	232959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259221
6084	NC_009484	GCC	2	6	232963	232968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259221
6085	NC_009484	AG	4	8	233000	233007	50 %	0 %	50 %	0 %	148259221
6086	NC_009484	TGC	2	6	233011	233016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259221
6087	NC_009484	CAG	2	6	233020	233025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259221
6088	NC_009484	CGA	2	6	233028	233033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259221
6089	NC_009484	GC	5	10	233040	233049	0 %	0 %	50 %	50 %	148259221
6090	NC_009484	TAA	2	6	233088	233093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148259222
6091	NC_009484	GAGGCG	2	12	233102	233113	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	148259222
6092	NC_009484	GCG	2	6	233145	233150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259222
6093	NC_009484	GCA	2	6	233197	233202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259222
6094	NC_009484	ACA	2	6	233221	233226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148259222
6095	NC_009484	GCG	2	6	233235	233240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259222
6096	NC_009484	GGC	2	6	233245	233250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259222
6097	NC_009484	GC	3	6	233277	233282	0 %	0 %	50 %	50 %	148259222
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6103	NC_009484	GTC	2	6	233522	233527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259222
6104	NC_009484	CGC	2	6	233533	233538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259222
6105	NC_009484	GTC	2	6	233541	233546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259222
6106	NC_009484	AGGGGC	2	12	233547	233558	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	148259222
6107	NC_009484	GC	3	6	233557	233562	0 %	0 %	50 %	50 %	148259222
6108	NC_009484	GGC	3	9	233579	233587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259222
6109	NC_009484	CG	3	6	233610	233615	0 %	0 %	50 %	50 %	148259222
6110	NC_009484	GCG	3	9	233613	233621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259222
6111	NC_009484	CG	3	6	233641	233646	0 %	0 %	50 %	50 %	148259222
6112	NC_009484	CGG	2	6	233697	233702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259222
6113	NC_009484	GAC	2	6	233714	233719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259222
6114	NC_009484	GTCG	2	8	233732	233739	0 %	25 %	50 %	25 %	148259222
6115	NC_009484	CGC	2	6	233826	233831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259222
6116	NC_009484	CGA	2	6	233842	233847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259222
6117	NC_009484	GCA	2	6	233854	233859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259222
6118	NC_009484	GCA	2	6	233866	233871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259222
6119	NC_009484	ATTCC	2	10	233887	233896	20 %	40 %	0 %	40 %	148259222
6120	NC_009484	CGTC	2	8	233901	233908	0 %	25 %	25 %	50 %	148259222
6121	NC_009484	TG	3	6	233953	233958	0 %	50 %	50 %	0 %	148259222
6122	NC_009484	ATA	2	6	233959	233964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148259222
6123	NC_009484	G	6	6	234061	234066	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_009484	ACC	2	6	234074	234079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259223
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6355	NC_009484	CCGGA	2	10	242781	242790	20 %	0 %	40 %	40 %	148259230
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6359	NC_009484	ACCG	2	8	242842	242849	25 %	0 %	25 %	50 %	148259230
6360	NC_009484	CCGG	2	8	242856	242863	0 %	0 %	50 %	50 %	148259230
6361	NC_009484	GCT	2	6	242870	242875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259230
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6364	NC_009484	CGG	2	6	243024	243029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259230
6365	NC_009484	CGG	2	6	243065	243070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259230
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6367	NC_009484	GTG	2	6	243150	243155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259230
6368	NC_009484	GC	3	6	243168	243173	0 %	0 %	50 %	50 %	148259230
6369	NC_009484	CGG	2	6	243209	243214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259230
6370	NC_009484	GCG	4	12	243221	243232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259230
6371	NC_009484	CGA	2	6	243269	243274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259230
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6373	NC_009484	CCGG	2	8	243348	243355	0 %	0 %	50 %	50 %	148259230
6374	NC_009484	GCG	2	6	243368	243373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259230
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6381	NC_009484	CGGC	3	12	243584	243595	0 %	0 %	50 %	50 %	148259230
6382	NC_009484	CGC	2	6	243635	243640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259230
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6453	NC_009484	CGA	2	6	245787	245792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259232
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6470	NC_009484	GCCTCG	2	12	246428	246439	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148259232
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6474	NC_009484	TGCCGG	2	12	246597	246608	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148259232
6475	NC_009484	GAC	2	6	246613	246618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259232
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6478	NC_009484	GCC	2	6	246796	246801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259232
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6480	NC_009484	CGC	2	6	246826	246831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259232
6481	NC_009484	ACC	2	6	246839	246844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259232
6482	NC_009484	CAG	2	6	246994	246999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259232
6483	NC_009484	GCG	2	6	247046	247051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259232
6484	NC_009484	CTC	2	6	247146	247151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6485	NC_009484	CG	3	6	247154	247159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6486	NC_009484	GCA	2	6	247180	247185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259233
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6488	NC_009484	GCG	2	6	247217	247222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259233
6489	NC_009484	CGGGG	2	10	247330	247339	0 %	0 %	80 %	20 %	148259233
6490	NC_009484	GCTGGT	2	12	247341	247352	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148259233
6491	NC_009484	CGGGG	2	10	247362	247371	0 %	0 %	80 %	20 %	148259233
6492	NC_009484	CGC	2	6	247406	247411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259233
6493	NC_009484	CGG	2	6	247412	247417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259233
6494	NC_009484	CGA	2	6	247452	247457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259233
6495	NC_009484	TCG	2	6	247487	247492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259233
6496	NC_009484	CCGGC	2	10	247618	247627	0 %	0 %	40 %	60 %	148259233
6497	NC_009484	CTC	2	6	247632	247637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259233
6498	NC_009484	GCC	2	6	247646	247651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259233
6499	NC_009484	GCTGGC	2	12	247653	247664	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148259233
6500	NC_009484	GCT	2	6	247695	247700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259233

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